L'acquario si trova in via Bosco Cerati, nella golena del fiume, oltre l'argine maestro. Si può arrivare all'acquario sia da Motta Baluffi che dalla sua frazione, Solarolo Monasterolo. Per i pullman è consigliabile passare da Motta Baluffi.
Vista la posizione a pochi metri dal Po e dall'attracco comunale, è possibile arrivare anche via fiume, con imbarcazione propria, contattando gli uffici comunali per l'ormeggio (tel 0375.969021), o in motonave con partenza da Cremona. Per maggiori informazioni su orari e tariffe, contattare il Consorzio Navigare l'Adda (tel 02.92273118).